员工自愿放弃社保并已签字，以下特殊情况或例外情形可能会影响问题的处理：1.员工属于灵活就业人员且已自行缴纳社保：如果员工本身是灵活就业人员，已在个人窗口缴纳了社保，并向公司出具了自愿放弃公司缴纳社保的声明，这种情况下虽然协议仍可能无效，但公司在处理时，可与员工协商沟通，说明政策规定，并根据实际情况考虑是否需要为其办理社保增员。不过，这并不改变公司的法定义务，最终仍需依法处理。2.员工与公司之间不存在真实劳动关系：若员工实为劳务派遣人员或其他非劳动关系，公司可能无需为其缴纳社保，但需有充分证据证明双方非劳动关系，否则仍需承担违法责任。这种情形下，劳动关系的认定是处理问题的关键。
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员工自愿放弃社保并已签字，公司操作的违法性可依据《中华人民共和国社会保险法》来明确。《中华人民共和国社会保险法》第五十八条（2018年修正）规定：“用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。”本案中，员工与公司即使有自愿放弃社保的签字，公司作为用人单位，仍负有在法定时限内为员工办理社保登记并缴纳社保费的强制性义务。该义务不因员工的单方放弃声明而消除，故公司未依法缴纳社保的行为违反了上述法律规定。
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员工自愿放弃社保并已签字，公司这样操作可能会面临以下法律风险点：1.补缴社保及滞纳金风险：例如，员工入职后公司未为其缴纳社保，即使有员工自愿放弃的签字，社保经办机构仍可责令公司限期补缴社保，并从欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金。2.员工投诉或仲裁风险：比如，员工后期因生病、养老等问题意识到社保的重要性，可能会向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司补缴社保或赔偿因未缴纳社保造成的损失，公司将面临败诉并承担相应责任。
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员工自愿放弃社保并已签字，公司在处理此事时，需避免以下常见的错误操作行为：1.认为有员工签字的放弃协议就万事大吉：部分公司误以为只要员工自愿签字放弃，就可以免除缴纳社保的义务，这是对法律的错误理解，该协议在法律上是无效的。2.用现金补贴代替缴纳社保：有些公司会给员工一定的现金补贴，让其自行缴纳社保，这种做法并不能免除公司的法定义务，员工仍可要求公司补缴社保。3.不及时为员工办理社保补缴手续：当意识到未缴纳社保违法后，不主动及时为员工补缴，会导致滞纳金、罚款等额外经济损失，还可能引发员工的投诉或仲裁。如果你公司存在上述错误操作，建议尽快纠正，如有需要，可进一步向律师咨询具体的补救措施。

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